assauseassauseさん、お返事ありがとうございます。
サーバーへのアクセスは「ESファイルエクスプローラ」というアプリで、対象の共有フォルダを開き、
PDFファイルを開く時にAcrobatReaderを指定しています。
その状態で注釈を付けて、そのままPDFを閉じる時に「保存されました」と表示されます。
ご指摘の通り、共有フォルダのファイルを開いても、その瞬間にローカルに取り込まれて、
それを編集した事になっているかもしれませんね。
直接サーバー上のファイルを開き、編集し、直接サーバーに保存する方法は無いでしょうか?