JavaScriptが含まれているかどうか、確認するのは難しいです。
機能的には様々な動作に関するものが含まれるためです。
実質的にできないと考えたほうがいいかもしれません。
PDFの脆弱性を利用した実際の被害については、当方も把握していません。
また脆弱性に関する問題はワールドワイド的なものでもありますので、
発見されたからといってただちに国内で影響するとは限りません。
しかし実際にはいつ影響するかわからないものでもありますので、
日々のセキュリティマネジメントを行う必要は欠かせないと思います。